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发掘甘薯蛋白质组:甘薯蛋白质组学和Proteogenomics分析(甘薯)叶和根
2020年08月29日    阅读量:     新闻来源:中国化工网 okmart.com  |  投稿

甜甜的淀粉状橙色甜土豆是炸薯条,砂锅菜和馅饼的美味和营养成分。尽管人类已经栽培了红薯数千年,但科学家们仍然对这些块茎的蛋白质组成了解不多。


在ACS的《蛋白质组研究杂志》中,研究人员分析了甘薯叶和根的蛋白质组,并在此过程中揭示了对该植物基因组的新见解中国化工网okmart.com


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除用于动物饲料和工业产品(例如生物燃料)以外,甘薯(番薯Ipomoea batatas,林木)是世界主要食品。


该植物具有令人惊讶的复杂基因组,比人类基因组编码更多的预测基因。


甘薯的化学成分也很复杂,其根部(人们食用的部分)蛋白质含量低,叶片中的次级代谢产物很多。


因此难以提取足够数量的蛋白质进行分析。Sorina和George Popescu及其同事希望了解蛋白质组学方法(一起分析蛋白质和遗传数据)是否可以帮助他们更好地了解甘薯根和叶的组成。


该团队使用两种不同的方法从根和叶样品中提取蛋白质,并将其切成肽,然后通过液相色谱和质谱分析。


研究人员从甘薯叶中鉴定出3143种独特蛋白质,从根部鉴定出2928种蛋白质。


当他们将蛋白质组学数据与甘薯的基因组进行比较时,他们发现了已发表的基因组序列中的某些区域,这些区域的数据可以提供增强的信息。


例如,分析预测了741个新的蛋白质编码区域,这些区域以前不被认为是基因。该小组说,这些结果可用于进一步鉴定和生物强化块茎。


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